В распоряжении Кафедры вычислительных систем находятся ряд специализированных лабораторий, на базе которых осуществляется подготовка студентов.

В апреле 2002 года создан Научно-учебный центр параллельных вычислительных технологий (ЦПВТ), базовой кафедрой для которого определена Кафедра вычислительных систем.